二十世纪末，在时任国务院总理的朱镕基同志的倡导和推动下，国务院于1998年7月批准成立国家会计学院，当时学院为国务院事业单位，由财政部代管，教学管理依托清华大学。2002年财政部发文将学院更名为“北京国家会计学院”。2012年学院纳入财政部所属事业单位机构编制。

　　建院以来，学院秉承朱镕基总理题写“诚信为本，操守为重，坚持准则，不做假账”的办学宗旨，为我国宏观经济管理部门、大中型企业以及社会中介机构培养了大批会计和审计高级专业人才。经过多年的发展，学院形成了以学位教育、中短期培训和远程教育为支柱的教育培训体系。学院拥有一支精通理论前沿及丰富实务经验的优秀师资队伍，在研究生培养过程中明确以提升职业能力为导向的培养目标，突出应用型人才培养特点，注重实践型、启发型教学。目前，相当比例的毕业生在大型企业和会计师事务所发挥骨干作用。